مواد غذایی در معده، از طریق اسید معده و آنزیم‌های موجود در آن مختصری هضم می‌شود، بطور طبیعی مقداری از این اسید معده وارد روده کوچک شده تا مواد غذایی بیشتر هضم شوند. در ریفلاکس مری، محتوای اسیدی معده به داخل مری (مسیر انتقال غذا از دهان به معده) باز می‌گردد که در برخی موارد، اسید وارد راه تنفسی شده و باعث ایجاد التهاب در مری، ریه و حنجره می‌شود. حدود ۱۰ درصد از این بیماران ممکن است دچار Barrett’s Esophagus شوند که این بیماری منجر به ایجاد سرطان مری خواهد شد.

یکی از روش‌های جراحی جهت درمان این بیماری، Fundoplication می‌باشد که طی این عمل انحنای بالای معده (فوندوس) به اطراف مری پیچیده و دوخته می‌شود. این امر باعث تقویت دریچه بین مری و معده (اسفنکتر تحتانی مری) شده و مانع از بازگشت اسید معده به داخل مری خواهد شد. این جراحی با روش حداقل تهاجم (لاپاروسکوپی) و از ناحیه شکم و یا قفسه سینه انجام می‌شود، در افراد چاق و یا بیمارانی که دارای مری کوتاه هستند، بهتر است عمل از طریق قفسه سینه انجام گیرد.